白巳津川市，仅有的特色也就仅仅只有作为学园都市这点。
主人公周遭发生了变化。由于大地震，神社中祭祀白蛇九十九的神器破损，来源于异世界的不可思议的装饰品“Artifact”（アーティファクト）流入了这个世界。
白巳津川市发生了使用超出人类认知范畴的力量，将人石化的事件。深知石化事件的犯人就是持有“魔眼的支配者”之人，主人公“新海翔”和同班同学“九条都”以及妹妹“新海天”一起开始了对连续石化事件的调查。在调查中，与自称“梨惧·吠陀”的Artifact使用者组织发生了冲突。而在“梨惧·吠陀”的成员中，竟然发现了学园前辈“香坂春风”的身影。
魔眼所有者的真实身份，Artifact的秘密，异能觉醒的少男少女的故事终于渐入佳境。